
近日,武汉医科大专一是附设醫院王学浩科学院院士团队图片在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向药物能量是什么消化吸收检测分析服务。
英语翻译文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕标题格式:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
加盟商企业单位:南京医科大学
探索建材:细胞
拜谱展示 服务于:转录组测序+核蛋白互作组+靶向治疗体力分解代谢组
技术应用路线地图:
探析效果
01、YBX1被监定为HCC中糖酵解的至关重要染色体
本论述信息采集HCC恶性肉瘤子样本(n=7)的单体体体细胞RNA测序数据统计信息集进行定量分享一下,发展糖酵解活性酶类核心集结在恶性肉瘤体体体细胞中,hdWGCNA定量分享一下识别图片出9个遗传基因模组(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的存活定量分享一下确认YBX1为自由存活危险 原则(图1H)。进一次整合IHC、WB研究和恶性肉瘤机构与靠近非恶性肉瘤机构的个人空间转录组学数据统计信息集灵魂存在YBX1是肝体体体细胞癌治愈的存在靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确定好为调整HCC组织糖酵解的关健环境因素
02、YBX1推动HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点体力分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1综合并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密联系并带动YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化不断增强其磷过酸,然而推进其核转位
进步骤检侧YBX1的O-GlcNAc糖基化是否有作用其磷过酸,在OGT敲低的HCC血肿瘤细胞中或用OGT压溶液剂OSMI-1治疗,YBX1核蛋清技术程度取得拉低,YBX1磷过酸取得减掉(图4A-C)。IP实验操作显示信息,在差不多的Flag-YBX1底物技术程度下,YBX1-WT的磷过酸技术程度取得高出YBX1-T57A,取决于磷过酸的加剧既仅是正原因更快的YBX1核蛋清传达出来(图4D)。分离出来了核和质酚类化合物发觉TMG治疗的HCC血肿瘤细胞中YBX1核传达出来的增加(图4E-F),进步骤发觉YBX1磷过酸的根本调整系数是AKT(图4G-I)。这种发觉突出O-GlcNAc糖基化用提高网站其磷过酸来强化YBX1核蛋清保持稳相关性并提高网站核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有助于于其进的一步引发磷酸性反应呈现并能驱动其核转位
05、YBX1可以淡化PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1推进PKM2转录
06、YBX1 并能挺高组核蛋白乳酸性反应体现标准
研究探讨看到YBX1敲低相关系数减少蛋清酶质乳硝化成用,特别的是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解可抑中药制剂2-DG的试验断定了糖酵解与组蛋清酶乳硝化成用的直观性关联性,可仰制糖酵解可相关系数减少H3K18la平行(图6D)。PKM2过展现可逆反应转YBX1敲低引起的H3K18la下调,之外源乳酸处置既改善H3K18la,还引起YBX1展现上浮,信息提示现实存在同向信息反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la经由含有于YBX1加载子直观性力促其转录,该整个过程受O-GlcNAc糖基化改善(图6H-J),并看到P300 上浮是YBX1增加H3K18乳酰化成用的缘由(图6K-L)。
图6.YBX1增強H3K18乳酸性反应淡化的水平
论文个人心得体会
在一项探讨中新闻了YBX1在HCC中高呈现方法,有时候与糖酵破译切涉及到的。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,才能不稳淀粉酶质并扩大其呈现方法。这类体现还有助于YBX1在T57处的磷过酸,有助于其核易位。往往,此整个过程激发了糖酵解涉及到的表观遗传的转录并刺激作用乳酸的呈现。另外,YBX1提高P300的转录,而使能够组淀粉酶的乳过酸,特点是H3K18la,H3K18乳过酸朝房产调控YBX1表观遗传转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观显性基因正负极馈环机能图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱海洋生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶点动能新陈代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、翻译工作后掩盖组学、分泌组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参考价值学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.